二周目通关推荐阵容需兼顾属性克制与技能互补。均衡型阵容通常包含妙蛙花、喷火龙、水箭龟三只初始宝可梦，形成草/火/水基础三角。电击兽作为高速电系输出可有效针对飞行与水系敌人，钢铁属性的大钢蛇提供防御支撑，暴鲤龙凭借水/龙双属性实现多功能作战。该组合覆盖八种常见属性，特殊攻击与物理攻击配比接近1:1，技能池包含睡眠粉、冲浪、雷电拳等关键招式。
特攻型阵容侧重爆发伤害与控场能力，核心成员包括胡地的精神冲击、海皇牙的冰冻光束、电击兽的十万伏特。狩猎鹰王凭借看穿技能提升命中率，班基拉斯通过恢复技能延长战场存活时间。此类阵容对操作要求较高，需频繁切换宝可梦维持属性优势，但能快速终结高难度战斗。携带道具推荐焦点镜片与剩饭，分别强化会心概率与持续恢复能力。
针对冠军之路的战术配置需额外考虑冰系与龙系对抗。急冻鸟的镜面反射可反弹特殊伤害，裂空座的龙之舞强化后能连续压制快龙等龙系对手。实测显示，携带攀瀑技能的暴鲤龙对地面系宝可梦造成伤害时可触发属性克制倍率，而妙蛙花的寄生种子在消耗战中可回复全员25%最大HP。注意保留至少两个技能位给变化类招式，如电磁波或剧毒。
后期岛屿探索建议补充传说宝可梦提升阵容上限。超梦70级时可学习精神干扰与自我再生，火焰鸟的圣火技能附带灼烧效果。获取途径包括灯火山顶层、华蓝洞窟等特定地点，捕获前需准备200个以上高级球与状态异常道具。二周目新增的七岛区域会出现等级压制现象，推荐将主力队伍平均等级提升至65级以上再挑战火箭队仓库。
道具管理与技能机分配直接影响战斗效率。每只宝可梦应配备专属属性增强道具，如神秘水滴强化水箭龟的水压技能。关键技能机如雷电、地震需优先分配给电击兽与尼多王，冲浪技能建议由两只以上宝可梦共享以应对不同战场环境。恢复类道具与PP回复剂储备量需维持在30个以上，特别是在挑战训练师之塔时。
阵容调整需根据实际战斗反馈动态优化。当遭遇格斗系强敌时可替换胡地为幽灵系耿鬼，面对岩石系阵容则启用派拉斯的吸血技能。二周目通关后仍可通过调整特性、个体值等参数进一步强化阵容，但基础属性克制关系始终是战术制定的首要依据。
